Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQC3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQC3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms