Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StambpQ9CQ26 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms