Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms