Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Msh4Q99MT2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Msh4Q99MT2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msh4Q99MT2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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