Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mccc1Q99MR8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mccc1Q99MR8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms