Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms