Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dok4Q99KE3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms