Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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