Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfxn1Q99JR1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms