Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxp3Q99JB6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms