Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prss28Q924N9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prss28Q924N9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prss28Q924N9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prss28Q924N9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Prss28Q924N9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prss28Q924N9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms