Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfcdQ922L6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms