Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms