Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usb1Q91W78 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usb1Q91W78 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usb1Q91W78 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usb1Q91W78 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usb1Q91W78 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usb1Q91W78 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usb1Q91W78 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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