Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms