Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn8Q91VA3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn8Q91VA3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms