Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klhdc3Q8VEM9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klhdc3Q8VEM9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms