Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms