Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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