Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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