Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpap2Q8VC34 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpap2Q8VC34 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms