Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops8Q8VBV7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms