Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms