Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms