Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms