Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms