Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Neurl3Q8CJC5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Neurl3Q8CJC5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Neurl3Q8CJC5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Neurl3Q8CJC5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Neurl3Q8CJC5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Neurl3Q8CJC5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Neurl3Q8CJC5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Neurl3Q8CJC5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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