Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap29Q8CGF1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgap29Q8CGF1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Arhgap29Q8CGF1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Arhgap29Q8CGF1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Arhgap29Q8CGF1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Arhgap29Q8CGF1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap29Q8CGF1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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