Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms