Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms