Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl11Q8CE33 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms