Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo43Q8CDI2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms