Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nhlrc3Q8CCH2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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