Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CC96 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CC96 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CC96 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CC96 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CC96 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CC96 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms