Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CntrobQ8CB62 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms