Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Atg4aQ8C9S8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Atg4aQ8C9S8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4aQ8C9S8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4aQ8C9S8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Atg4aQ8C9S8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Atg4aQ8C9S8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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