Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc187Q8C5V8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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