Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms