Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Iffo1Q8BXL9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Iffo1Q8BXL9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Iffo1Q8BXL9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Iffo1Q8BXL9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Iffo1Q8BXL9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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