Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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