Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms