Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVW3

Trim14, Tripartite motif-containing protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim14Q8BVW3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim14Q8BVW3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms