Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms