Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms