Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms