Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-M10.4Q85ZW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-M10.4Q85ZW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-M10.4Q85ZW8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-M10.4Q85ZW8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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