Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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