Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms