Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms