Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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